Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzd9Q9D9M4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd9Q9D9M4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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