Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms