Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus10Q9D3U0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pus10Q9D3U0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pus10Q9D3U0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pus10Q9D3U0 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pus10Q9D3U0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pus10Q9D3U0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pus10Q9D3U0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pus10Q9D3U0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pus10Q9D3U0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms