Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl17Q9CPR4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms