Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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