Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms