Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms