Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms