Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms