Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms