Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trerf1Q8BXJ2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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