Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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