Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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