Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed3Q78IS1 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms