Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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