Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Zbtb40Q6PCS8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb40Q6PCS8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms