Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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