Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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