Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tbr1Q64336 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tbr1Q64336 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms