Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms