Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sec24aQ3U2P1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms