Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Q3U1D9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Q3U1D9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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