Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms