Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms