Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms