Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms