Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Taf1bP97358 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms