Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms