Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpdP50404 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpdP50404 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms