Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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