Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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