Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa2P28309 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms