Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd12P23812 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd12P23812 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd12P23812 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hoxd12P23812 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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