Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18525 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18525 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18525 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms