Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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