Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms