Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Becn2P0DM65 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms