Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms