Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk2a2O54833 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms