Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq1O09165 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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