Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Gm20878L7N244 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm20878L7N244 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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