Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms