Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8356J3QPD3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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