Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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