Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colca2F8VPY8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colca2F8VPY8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms