Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms