Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apba1B2RUJ5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apba1B2RUJ5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apba1B2RUJ5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms