Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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