Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms