Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col5a3Q9JLI2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms